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お問い合わせありがとうございます。

開始残高を登録したことにより作成された取引は、「支払行(payments)」と「+更新(renews)」の更新が可能です。
※開始残高から登録された取引の取引先や金額等は会計freee上でも編集ができかねてしまうためAPIのPUTでも更新できかねてしまいます。

それぞれのリファレンスを記載させていただきましたのでご確認いただけますと幸いです。
・支払行(payments)
https://developer.freee.co.jp/docs/accounting/reference#/Payments/update_deal_payment

・+更新(renews)
https://developer.freee.co.jp/docs/accounting/reference#/Renews/update_deal_renew

もし上記内容でご不明点がございましたらお気軽にお問合せくださいませ。

どうぞよろしくお願い致します。