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お時間頂きありがとうございます。
確認が終わりましたので回答いたします。

1. 勘定科目の名称は一意かどうか?

事業所ごとに一意となります。
事業所をまたいださいは、同一の名称が存在する可能性はございます。

2. リスト内の末尾の要素が常に小分類かどうか?

はい。
その認識でお間違いありません。

3. 小分類の一覧表等

下記のURLよりエクスポートいただけます。
https://secure.freee.co.jp/account_items

添付資料をご参考にご利用ください。

ご確認どうぞよろしくお願いいたします。